تتكون عملية زراعة الشتلات في الصندوق من مراحل مختلفة. ومن بين التربة المناسبة لزراعة شتلات الصندوق، فإن أهم خصائص التربة الجيدة لصندوق الشتلات هي الحموضة المناسبة (PH)، والقوام المتوسط مع وجود مادة عضوية كافية وقدرة على الاحتفاظ بالماء. التربة الطينية (الطينية الممزوجة بالطينية والمواد النباتية) وهي التربة الأكثر ملائمة لهذا الغرض.
تبلغ كمية التربة اللازمة للصندوق الواحد حوالي 5 كجم. يجب أن يكون عمق قاع التربة في صندوق الشتل 2 سم، وسمك التربة المستخدمة لتغطية البذور 0.5 سم.
تنظيف التربة وتجفيفها عن طريق جمع التربة قبل 2 إلى 3 أشهر من الزراعة، وضبط درجة الحموضة (PH) لتربة المشتل، واستخدام الأسمدة في صندوق تربية الشتلات، وإعداد بذور عالية الجودة في الأرز، واختيار البذور باستخدام الوزن خاصة أن تطهير البذور ونقع بذور الأرز وتسريع الإنبات، وهي تدابير كافية لتسريع الإنبات قبل البذر، يسبب التوحيد في إنبات البذور، وهو بداية جيدة لنمو نباتات الأرز، وكذلك عملية البذر، وملء صناديق البذور بالبذور. التربة، ري الصناديق، كمية البذور، إدارة إنبات البذور في غرفة النمو، التخضير الأولي، تجهيز القبو في الأرض الرئيسية ونقل صناديق الشتل إلى القبو، إعداد سرير القبو، وضع الصناديق في وسرير الخزينة هو أحد المراحل الأخرى لزراعة شتلات الأرز في الصناديق.
والفرق الرئيسي بين زراعة الأرز الآلية والتقليدية هو في عمليات الزرع، والغرس والحصاد، والتي في النظام الآلي، حلت الآلات محل العمل البشري في هذه المراحل. الغرض من زراعة الأرز الآلية هو تقليل صعوبة العمل، والزراعة المنتظمة والهندسية بحيث يتم توفير الكثافة النباتية المطلوبة لكل وحدة مساحة، وزيادة الإنتاجية وتحقيق الإدارة الكلية.
