Hammaddelerde fark
Muffin ve keklerin malzemeleri farklıdır. Muffin un, süt ve yumurtadan yapılır. Cupcakelerin temel malzemeleri arasında tereyağı ve temel kek malzemeleri yer alırken, yüksek miktarda şeker içerir. Aslında bu bölümde bu iki besinin hazırlanmasında kullanılan şeker ve tereyağı temel fark faktörleridir. Çünkü muffinlerde keklere göre daha az şeker bulunur ve bunların yapımında bitkisel yağlar kullanılır.
Hamurdaki fark
Cupcake ve muffinler hamur açısından da birbirinden farklıdır. Cupcake hamuru muffinden çok daha pürüzsüz ve yumuşaktır. Aslında kek üretmek için tereyağı ve şekeri karıştırıp yumuşak ve kabarık bir hamur elde ediyorlar. Ancak çörek hamuru çok daha kalındır. Muffinlerde hamurun daha kalın olması bu ürünü yoğunluk açısından cupcakelerden farklı kılmaktadır. Aslında muffinlerin yoğunluğu keklerden daha yüksektir.
Dokudaki fark
Bu iki yiyeceğin dokusu da farklıdır. Kekin dokusu çok yumuşaktır ve bu yiyecek asla çıtır veya yoğun olmaz. Kırmızının karşısında muffin bu açıdan kekten farklıdır. Aslında çörek yoğun ve sıkı bir dokuya sahiptir.
Bakım ve sedir farkı
Muffinler sıcak ve soğuk olarak saklanabilir ve servis edilebilir. Ancak öte yandan durum böyle değil ve kekler yalnızca buzdolabında saklanıp soğuk olarak servis edilebilir.
Boyut ve şekil farkı
Normalde muffinler keklere göre daha büyük boyutlara sahiptir ve piştikten sonra biraz kalıptan çıkıp mantar gibi bir hal alırlar. Kekler genellikle kalıbın veya kağıdın kenarından yukarı çıkmıyorsa.